mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATTAA AGTGAGTGAGGGTCCAGTGTTTCACA GTACTACTGTTTTTAGTGAGTGAGGGTCCAGTGTTTCACATTGTTTGCTTAAGTATTTGTGACTAGATCCACACTCATTAAAAACGGTAGTTC 2 4 3' arm Drosophila_mojavensis mirbase mir-279 7e-33 dvi-mir-279 4e-34 -40.9 ..((((((((((((((((((((.(((((.((....(((((.....(((....)))..))))))).))))).)))))))))))))))))))).. (-40.90)