mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCATGGAATTGCTCTCTTTGT AAAGAGAGCTGTCCGTCGACAGT CGAATAGGTGAATAAAGAGAGCTGTCCGTCGACAGTCAACGTACCAATTTAATACTGTCATGGAATTGCTCTCTTTGTATAATATTCG 2 2 3' arm Drosophila_persimilis mirbase mir-46 0.00007 dps-mir-281-1 7e-45 -33.73 ((((((..((.(((((((((((..(((((.((((((.................)))))))))))...))))))))))).)).)))))) (-33.73)