mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC TCACAAAGTGGTTGTGAAATG GCTGGGCTCACAAAGTGGTTGTGAAATGCATTTTGCTTTGCCCGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTCGGC 1 2 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-2 5e-33 dpe-mir-2a-1 1e-36 -40.14 ((((((((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))).))))).)))))))))) (-40.14)