mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGAGGAGC TCTTTAAAGTGGCGGTGACGTG CTGCGACGCTCTTTAAAGTGGCGGTGACGTGTTGGTAATAATATTCATATCACAGCCAGCTTTGAGGAGCGTTGCGG 3 1 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-2 1e-27 dsi-mir-2b-1 4e-21 -41.9 ((((((((((((((((((((((.((((..((...((....))...))..)))).)))).)))))))))))))))))) (-41.90)