mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGGGC CATCAAAAATGGCTGAAGAAAGATATA TGGTATCCTTACTTTCAGTGTCATCAAAAATGGCTGAAGAAAGATATATTTGCATTTGAAGCGTATCACAGCCAGCTTTGATGGGCATTGCAATGAGCATCGA 3 6 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-2 7e-18 dpe-mir-2c 9e-54 -27.1 .(((...((((.((.(((((((((((((..((((((......(((((.(((......)))..))))).))))))..)))))).))))))).)))))).))).. (-27.10)