mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTGGGCAAAGTGTGTCTCA GGATGCATTTTGTGCAGTTATG GATCCTGGGATGCATTTTGTGCAGTTATGTCTACGTGATCATCCTCATCACTGGGCAAAGTGTGTCTCAGGAT 2 0 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-3 8e-35 dpe-mir-3 5e-36 -34.39 .(((((((((((((((((((.((((.(((................))).)))).))))))))))))))))))) (-34.39)