mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGTGGCTGTTCTTTTT AGAGAATAGTTGCTGTGCTATA TTTGAAGTAGAGAGAATAGTTGCTGTGCTATATGTCCTTCGACTCTATATATCACAGTGGCTGTTCTTTTTGTACCTAAA 3 0 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-6 2e-35 dpe-mir-6-1 1e-33 -29.8 .......(((((((((((((..(((((.((((((((....)))...))))).)))))..)))))))))))))........ (-29.80)