mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGTGGCTGTTCTTTTT AGGGAACGGTTGCTGCTGATGTA CAAAAAGAAGGGAACGGTTGCTGCTGATGTAGTTCAAGTTTTGCACAATTTATATCACAGTGGCTGTTCTTTTTTGTTTG 2 1 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-6 6e-36 dpe-mir-6-2 9e-38 -30.2 ((((.(((((((((((((..(((.((((((((.....(.....).....)))))))))))..))))))))))))).)))) (-30.20)