mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AACAATAAATCCCTTGTCTTCTTAC GAGTGTATTCCGTATGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTGGTCTCTGCTAATAACAATAAATCCCTTGTCTTCTTACGGCGTGCATCT 3 2 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-7 4e-31 dpe-mir-7 7e-45 -32 ..((((((.(((((.(((((((.((.((((((((((((.(((....))))))))))..))))).)).)))))))))))).)))))).. (-32.00)