mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTGATTTTAGCTGTATG TAGAGCTTTATCACCAAAACCC TGCACATTATTTGATCTTTGGTGATTTTAGCTGTATGGTGTATATCAAAGATCCATAGAGCTTTATCACCAAAACCCAAATGGTTTTTGCA 5 1 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dpe-mir-9b 1e-46 -31.44 .(((.((((((((...(((((((((...((((.(((((..............))))).))))..)))))))))...))))))))...))). (-31.44)