mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAAGATGTCGGCATAGCTGA CGCTATGCTGCATCTAGTCAGT TCTGTTGGTAAATTGGCAAGATGTCGGCATAGCTGAAGTTGAAAAGCGATCTTTGAGAACGCTATGCTGCATCTAGTCAGTTATTCAATGGA 4 1 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-31 1e-43 dpe-mir-31a 3e-47 -37.3 ((((((((..(((((((.(((((.(((((((((....(((....)))..((.....))..)))))))))))))).)))))))..)))))))) (-37.30)