mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTTGACATCGGGTCAGAT TACAACGGCTGTATGTAGCTGGTTGACATCGGGTCAGATCTATTTTATCAAGTATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTATCAGTGGTTGATTCCAAC 5 1 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-133 1e-43 dpe-mir-133 5e-46 -39.4 ..((((.((((.((((((((((((((....((..(((((((.........)).)))))..))...)))))))))))))))))).))))........ (-39.40)