mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGTGGGACTTTCGTCCGTTT CCGGACGATGGTTCACAACGACC GTAATGGTACGGTGCGACCGGACGATGGTTCACAACGACCGTGTCTCTTAAACTGGTCGGTGGGACTTTCGTCCGTTTGTAACGCCATTTGTCAGCGA 3 1 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-278 3e-35 dpe-mir-278 1e-46 -39 ..((((((....(((((.(((((((.(((((.((.((((((.((.......)))))))).))))))).))))))).)))))..))))))......... (-39.00)