mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATTAA AGTGAGTGAGGGTCCAGTGTTTCACA TCATACTACTGTTTTTAGTGAGTGAGGGTCCAGTGTTTCACATTGATTTTCTTAGTATTTGTGACTAGATCCACACTCATTAATAACGGTAGTTC 2 4 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-279 1e-40 dpe-mir-279 8e-48 -37.3 ....(((((((((.((((((((((.(((((.((....(((((...(((.....)))...))))))).))))).)))))))))).))))))))).. (-37.30)