mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTATTTACGTTGCATATGAAATGATA TTATTTTATATGCAGGTATGTGCAGC GGCTTTTATGTATTTACGTTGCATATGAAATGATATTTATAGTAAACAGATTATTTTATATGCAGGTATGTGCAGCTGAAGAGCCTGTCCATTG 2 1 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-280 3e-35 dpe-mir-280 3e-44 -31.6 (((((((.(((((.(((.((((((((((((((((.((((...))))...))))))))))))))))))).)))))....)))))))......... (-31.60)