mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATATTTAAGTGGAGCCTGCGACT CTCTCCGACTGGGCTAACTCACTTGAGCGTTTGTT GAGTTTACAGTGAAATAAATATTTAAGTGGAGCCTGCGACTGGGACTCCAGCTCTCCGACTGGGCTAACTCACTTGAGCGTTTGTTGGCACGTAAAAGAC 3 9 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-289 9e-51 dpe-mir-289 3e-50 -30.3 ...(((((.(((.((((((..(((((((((((((((.((((((....)))).)).).....)))))...)))))))))..))))))..)))))))).... (-30.30)