mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATCTCAATTTGTAAATGTGAG CACTTTGCAACTGGAGATTGCT GCAGCATTGAATAATCTCAATTTGTAAATGTGAGCGATTTGAGGCATTTGACACACTCACTTTGCAACTGGAGATTGCTCGAAACTGC 3 1 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-304 1e-43 dan-mir-304 2e-35 -28.1 ((((..((((.(((((((...(((((((.(((((.(..(..((...))..)..).))))))))))))...))))))).))))..)))) (-28.10)