mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTCGAGCCAATAAGTTCGG GTAACTTGTGTGGCTTCGAATGTACC TCGTAACTTGTGTGGCTTCGAATGTACCTAGTTGAGGAAAACTCCGAAATGGATTTTGTTACCTCTGGTATTCGAGCCAATAAGTTCGG 1 5 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-314 3e-44 dpe-mir-314 2e-45 -30.3 .((.(((((((.(((((.(((..(((((.....((((.(((.(((.....))).)))....)))).)))))))))))))))))))))). (-30.30)