mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTGATTGTTGCTCAGAAAGC TTTCGAGCAATTATCAAAGCC CACTTATCTATTTTTGATTGTTGCTCAGAAAGCCCTTATAATTAACCAGTTGGCTTTCGAGCAATTATCAAAGCCAAATAAGTG 1 1 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase mir-315 3e-41 dpe-mir-315 2e-42 -29.93 (((((((....(((((((.(((((((.(((((((.................)))))))))))))).)))))))....))))))) (-29.93)