mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGTTCGTTTGGCTTAAGTTA ACTTGGGCCAGGGGAATTCAAACT GGGCAGCGAATTACTTGGGCCAGGGGAATTCAAACTGTGATCGCAATGCAAAAAGTTTGTTCGTTTGGCTTAAGTTATTTTCATGCCTC 3 2 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dme-mir-375 8e-23 -32.4 (((((..(((..((((((((((((.(((..((((((.((.........))...))))))))).))))))))))))....))).))))). (-32.40)