mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAACCGTCCAAAACTGAGGC CCTTAGTTTTCGACGTGTTTTGGT TGTCCACAATGGACCTTAGTTTTCGACGTGTTTTGGTGTGCTGGGGAGTTGATATTCCGATTGAAACCGTCCAAAACTGAGGCCAACTGTGCGGCAT 3 2 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dme-mir-957 4e-37 -38.7 ((((((((.(((.((((((((((.((((.((((..((.......(((((....))))).))..)))))))).)))))))))))))..)))).)))). (-38.70)