mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTGTTACTTCTTACAGTGA GCTGTAAATTGTAATGGCCAAAG GGACCCCATCGCTCGCTGTAAATTGTAATGGCCAAAGCTTTTTTGTTGGTAGCAGCTTGGTGTTACTTCTTACAGTGAGTGTGGAGCGTTTCCA 3 1 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dme-mir-971 0.0000000003 -34.2 ((((((((.((((((((((((...((((((.((((.(((.((........)).)))))))))))))...))))))))))))))).).)..))). (-34.20)