mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGATGTGACGTAGTGGAACA GGCCACTACCTCGCAGTCACGTG ACGTTGCGGGAATGGGCCACTACCTCGCAGTCACGTGATATCGGAATGCAATGATCTACGTTAAATTGTGTTTCTTTTTGAATAGTTCATGTGATGTGACGTAGTGGAACATTCCTGGCG 3 1 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dme-mir-989 0.000000000002 -49.2 .(((..((((((((..(((((((.(((((.((((((((..((((((((((((............)))))))))).....)).....))))))))))))).)))))))..))))))))))) (-49.20)