mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAAGCTCGTCTCTACAGGTATCT CTACCCTGTAGTTCCGGGCTTTTG CTCCCGTGACCTACCCTGTAGTTCCGGGCTTTTGTTTATATTGCGCCCGATGTATTTTCGAGTGTTTGTGTCGATTATCAGAAGCTCGTCTCTACAGGTATCTCACAGGGTAGA 5 1 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dsi-mir-993 2e-24 -42.5 (((((((((..((((.(((((...((((((((((.((((((.((((.(((.......))).))))..)))).))....))))))))))...)))))))))..)))).))).)). (-42.50)