mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATATTGTCCTGTCACAGCAGTA CTGCTGGGTCGGGGCATTAACA GGCGCTTGCCATTGATATTGTCCTGTCACAGCAGTATTGTAACTTAATTATAGCCTACTGCTGGGTCGGGGCATTAACATTGTTGAGCGCC 4 0 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dme-mir-1000 2e-29 -41.9 (((((((..((.((.((.(((((((.(.((((((((((((((.....))))))..)))))))).).))))))).)).)).))..))))))) (-41.90)