mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATTCGATTTCTTATTCATAG TCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAA GCGTCAACTTTCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAATTGTTTGTGCCAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGC 4 7 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dsi-mir-1006 3e-28 -18 ......((((....((((((..(((((((((.....(((((((.......)))))))..)))))))))..)))))))))).. (-18.00)