mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAG AACGGGTAAGTGGTGTAGATGAAACA CGTCCGTGTTCGTGCTCAACGGGTAAGTGGTGTAGATGAAACAAATTAACCAACCTTTATTGTGTTGGATTGTTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGGTACGAGGAT 3 3 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dsi-mir-1010 1e-34 -34.9 .((((....(((((((......((((((((.((((.((((((((.((((((((......))).))))).)))))))).))))....)))))))).))))))))))) (-34.90)