mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGATTTGGTGGATTTGAAAA TTCAGATCCTCAAATACCATATG CCGGGTCAAATGGTCCAGAGTTTTCAGATCCTCAAATACCATATGTATTATTTGACTTTCATATTGATTTGGTGGATTTGAAAACTTTTCACTTAAGAACACTTG 1 2 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dps-mir-2517a-2 6e-55 -29.24 ..((..(....)..)).((((((((((((((((((((.(.(((((..............))))).))))))).)))))))))))))).................. (-29.24)