mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGATTTGGTGGATTTGAAAA TTCAGATCCTCAAATACCATATG GGGTGAAATGGTCCAGAGTTTTCAGATCCTCAAATACCATATGTATTATTTGACTTTCATATTGATTTGGTGGATTTGAAAACTTTTCACCACATATACATCC 1 2 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dps-mir-2517a-1 1e-43 -33.14 (((((...((((..(((((((((((((((((((((.(.(((((..............))))).))))))).)))))))))))))))..))))......))))) (-33.14)