mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCAGATCCTCAAATACAATATG TATTGATTTGGTGNNATTTGAAAA GCCGGGTCAAATGGTCCAGAGTTTTCAGATCCTCAAATACAATATGTATTATTTGAATTTCATATTGATTTGGTGNNATTTGAAAACTTTTCACTTAAGAACNNNNNNTACTGGT 2 3 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dps-mir-2517a-1 3e-41 -27.3 (((((.((....(((..(((((((((((((..((((((.(((((((.(((.....)))..)))))))))))))....)))))))))))))..)))...))..........))))) (-27.30)