mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGATTGTTGTCTGGCTCGGTG TCGGACCAGGCTTCAATCCCT ATCATGCTCGGATTGGGTTAGGGGGATTGTTGTCTGGCTCGGTGTCTCCGGTCGAGACGGCCTTGCCGGCGCCGGAGCTGTCGTCGACCGGAGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCATGCGGCATTAGGT GCAGCTCCTAGCTCCTCCTTTCTTCCACCACCATCCTGAAGCAAGCAGTGCAGCTTGCTCTCACGAACCTAGCTAGTTTCTTCTCTGTCTATATATATGCTCCTCAGATCCACTTCGCATCATCACTTCAGCTCCTTCGTCATGGGGGTTTGTGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCAGCATCCGCGTCCTAGCCTGCTGTTGCCGGTCGTTTTGCCTGCTACCGGTCGGCCGGACAGATCGAGGCGTCGGACCAGGCCTCATTCCTCGCAAACCGGTGCATCCATGGTGTCTTACCTATCTCGGCTCATGGTTCTTCTAGAGTTCTAGTAGCTAGCAACCAGCTATAGTTCTCTTACAAACATATATCAGGTAGCTAGGGATAGCCAGCCAGATAATTTCATGCATACGTACTGCCTCATCATGCTCGGATTGGGTTAGGGGGATTGTTGTCTGGCTCGGTGTCTCCGGTCGAGACGGCCTTGCCGGCGCCGGAGCTGTCGTCGACCGGAGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCATGCGGCATTAGGTCATCTGGATCTCGGCGGTGTCCGACAAAGTACACCGCATCGGCCGGTAAGCTAACCTATCTTGAGACTCGAGCACATAAATTCTCAGCTAGCCTCACTTTCTCTACATGGTCATTCATCAGCAACTCCCGCGCGCGAGTGGCTCGTTTTCTTTCCCAGCTCCAGATCTGCTCCCGCTTTATTTGCTGTGAGTAGCTAGCATGCGACGATGAGATGTCGATCCAGCTGGACCTGGAGAGGTCGTTGCTGTCACGCTGAAGTCGTTTTGCTGACTACTAGGCTACTAATGACGACTGGTTAATTAGCGGCGTTTACGTACATGCATGTTGCTGCATGATCATGCAATCATT 4 0 5' arm Zea_mays mirnest mir-166 4e-54 zma-MIR166n 3e-48 -72.5 ...(((((((.....((((((((((((((..((((((.((((.((((((((((((((((((((.((....)).)).)))))).)))))))))))).)))).))))))..)))))))))))))).)).)))))..... (-72.5)