mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTTTTGCTCGGACATTTATGT ATAGATGGTTGCAGCATAAATAGA GGGCTTATATTTGTATTTTTGCTCGGACATTTATGTACAATTTGAGCGTCATAGATGGTTGCAGCATAAATAGAATTATTAGCCC 4 1 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dps-mir-2542-2 4e-43 -28.1 (((((.(((.((.(((((.((((((..((((((((.((.........))))))))))..)).)))).))))).)).))).))))) (-28.10)