mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGCAACGGCAGATAGGAGCA ATCCTATCTGCTGTGGTTTATG CCTGCCAGAGAGGGCTTTTGGTTTATCCTATCTGCTGTGGTTTATGTACAATTCGAAAGTCATATGCAACGGCAGATAGGAGCAATCATTAGCCACAAAGCCAACTATCCGTGGGA 5 0 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dps-mir-2543a-1 2e-61 -45.6 ((..(...((..(((((((((((..(((((((((((((.((.((((.((.........)))))).)).))))))))))))).........))))).))))))..))....)..)). (-45.60)