mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATTCTTCTACTGCGCGAGGG CTCACGCAGTACAAGAATTTC TCCTCCTCAAGGAGGAAATTCTTCTACTGCGCGAGGGCATAGGGCAGATTCTCAATATTCCCTGGGCTCTGCTGTCCGATGCCCTCACGCAGTACAAGAATTTCCTCCTCGAGGAGGA 2 0 5' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dps-mir-2545b 4e-53 -79.9 ((((((((.((((((((((((((.(((((((.((((((((.((((((...((((........)))).....)))))).)))))))).))))))).)))))))))))))).)))))))) (-79.90)