mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCACGCAGTACAAGAATTTC AATGTTCTACTGCGCGAGGG TCCTCCTCAAGGAGTAAATGTTCTACTGCGCGAGGGCATAGGGCAGATTCTCAATATTCCCTGGGCTCTGCTGTCCGATGCCCTCACGCAGTACAAGAATTTCCTCCTCGAGGAGGA 4 1 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 dps-mir-2545a 4e-53 -65.4 ((((((((.(((((.((((.((.(((((((.((((((((.((((((...((((........)))).....)))))).)))))))).))))))).))..)))).))))).)))))))) (-65.40)