mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTGTCAGCTTCCAGCAGC TGGTGGATTAACTGTTGCCAAAAG GAAAGTTGCAGTCCTGCCAGCTGGTGGATTAACTGTTGCCAAAAGCTCAACTTTAAAAAGCTTTGGTGTCAGCTTCCAGCAGCTGGCGGGGAAGCGAC 4 2 3' arm Drosophila_pseudoobscura mirbase 100 100 -50.2 ....(((((..((((((((((((.((((....(((.(((((((.(((...........)))))))))).)))..)))).))))))))))))..))))) (-50.20)