mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGAGGAGC TCTTCAAAGTGGCGGTGACATG CTTCAACTGTCTTCAAAGTGGCGGTGACATGTTGTCAACAATATTCATATCACAGCCAGCTTTGAGGAGCGTTGTGG 5 1 3' arm Drosophila_sechellia mirbase mir-2 5e-30 dsi-mir-2b-1 1e-36 -28.6 ((.((((..(((((((((((((.((((.((((((....)))))).....)))).)))).)))))))))..)))).)) (-28.60)