mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGTGGCTGTTCTTTTT AGGGAATAGTTGCTGTGCTGTA AGTAGAGGGAATAGTTGCTGTGCTGTAAGTTAATATACCATATCTATATCACAGTGGCTGTTCTTTTTGTA 3 0 3' arm Drosophila_sechellia mirbase mir-6 3e-31 dme-mir-6-1 3e-34 -25.7 ..(((((((((((((..(((((.((((..(...........)..)))).)))))..))))))))))))).. (-25.70)