mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA ATGTGCCCATCTTCTCCACC GCACTTGAGAGATGTGTGTGTGGTAGACGGTGGCTGTGCGTGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACCATCCAATGCCGCCGGGTGGGTGGGTGGAATGGATGGATGGTTCTTGATGTGCCCATCTTCTCCACCGAGCACGAACTGTCTTGGATCCGCGCGCGCGTGCCGTACA TGCGAAGCTGAGTGCAGACGTCCGATCCCCGATCCATGGCTCCTTTTCTGGCACTTGAGAGATGTGTGTGTGGTAGACGGTGGCTGTGCGTGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACCATCCAATGCCGCCGGGTGGGTGGGTGGAATGGATGGATGGTTCTTGATGTGCCCATCTTCTCCACCGAGCACGAACTGTCTTGGATCCGCGCGCGCGTGCCGTACATACCTCGTCATGCAGGAGTTCAGGTGCTGCCTAATCCTCGGCGGCCCTCACCGCGCCACCGGCGTCTCGCGTCGTCGCTGCCGATCGATCGATCGTCCAGCCCGCCGCCAGTTGAGTTCCGAACCCCGATGCTTATAGCCTCCCATCCCTGGTTAGCAAGCATCGTGTGTATCTTGCATCTCAGACTTGCTTCCTCTTCATCATTCATTCATTCATACTCAAGCATTAATTATTCAGGACCAAGCAAGCGGTAGAATTCAAATTCAATTCGCACAACCCTTTGCTTGTCAGCTAGCTTACCTTGTGTATTGGATTTGAATACATGCTGGTAATCCATCTAATAAGAAAGCGCTGTGTGGCGCTACCTGTCCGTAGTATGGCCGCGCCGACTGTCTGTCGGCTGGCATGGCATGATATACATTCTAGTTATCTTGAACCAAAGGCGACTGTCCGTAGAGTTGCTTGCTCTTGCTTCAGCAGGTGGGAATGGCGCCGTGCACTTGGGTTCGCCTGTCTCAGTTACCAGAGGAGCCTAATCCCATCGTCGCTCGTACGTCGCTCGGATGTCGGCATCAACGACCAGCGCGGCAGCCAGCATGCACAGGCCCGCCGAGAATGATCAGGG 2 1 5' arm Zea_mays mirnest MIR164 5e-17 zma-MIR164b 2e-68 -83 ((((((....)).((((((((((.(((((((...(((((.(((((((((((..((((((((.((..((((((((...(((((.........)))))......))))))))...))))))))))..))))))))))).))))).))))))).....))))))))))))))...... (-83)