mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATTAA AGTGGGTGGGGGTCCAGTGTTTCACA ATACTGCTGTTTTTAGTGGGTGGGGGTCCAGTGTTTCACATTGATTTTCTTAGTATTTGTGACTAGATCCACACTCATTAATAACGGTAGTTC 2 4 3' arm Drosophila_sechellia mirbase mir-279 1e-46 dsi-mir-279 7e-48 -36.4 ..(((((((((.((((((((((.(((((.((....(((((...(((.....)))...))))))).))))).)))))))))).))))))))).. (-36.40)