mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACATTCACCGGCCTGA GGACGGTATATGAGTCAATGTT TCTAGATAATTTTTCGGACGGTATATGAGTCAATGTTTTCTTTTTCGAATATATTGCACATTCACCGGCCTGAAAATATCAAGA 4 2 3' arm Drosophila_sechellia mirbase 100 dsi-mir-311 5e-30 -24.6 (((.((((..(((((((.((((..(((.(.((((((.(((......))).))))))).)))..))))..))))))))))).))) (-24.60)