mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGGAG CCATGCTTCCTTGCATTCAATA CAGCCTTTGAGAGTTCCATGCTTCCTTGCATTCAATAGTTATACTCAAGCATATGGAATGTAAAGAAGTATGGAGCGAAATCTGGCGA 2 0 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-1 4.0E-25 dse-mir-1 7.0E-45 -36.2 ..(((...((..((((((((((((.((((((((.((((((.......))).))).)))))))).))))))))))))....)).))).. (-36.20)