mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC CTCATCAAGTGGTTGTGATATG ATCTAAGCCTCATCAAGTGGTTGTGATATGGATACCCAACGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTAGGAT 0 3 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-2 1.0E-27 dan-mir-2a-2 2.0E-35 -32.9 ((((.(((.((((((((((((((((((((((........).)))))))))))))..))))))))))).)))) (-32.90)