mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGAGGAGC TCTTCAAAGTGGTTGTGAAATG TTGTGTCATTCTTCAAAGTGGTTGTGAAATGTTTGCCTTTTTATGCCTATTCATATCACAGCCAGCTTTGAGGAGCGACGCGA 2 1 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-2 6e-33 der-mir-2b-2 6e-42 -36.9 (((((((.(((((((((((((((((((.(((...((........)).....))).))))))))).)))))))))).))))))) (-36.90)