mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAAGCTAGACAACCATTGA TTTGGTCGTCCAGCCTTAGGTGA TTGCAATTAGTTTCTTTGGTCGTCCAGCCTTAGGTGACTTTTCCGATCATAAAGCTAGACAACCATTGAAGTTCGTTGTGG 7 2 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dse-mir-4 9e-41 -22.3 (..((((.(..(((..((((.(((.(((.....(((((......).))))...))).))).))))..)))..).))))..) (-22.30)