mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGGAACGATCGTTGTGATATG TATCACAGTGATTTTCCTTTAT TAAAAGGAACGATCGTTGTGATATGAGTTGTTCCCAACATATCACAGTGATTTTCCTTTATAT 1 1 5' arm Drosophila_simulans mirbase mir-5 6e-29 dse-mir-5 2e-25 -22.9 ..(((((((.((((((((((((((..((((....))))))))))))))))))))))))).... (-22.90)