mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGCTTACCGAAGTTA GCTATGTTGTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGATAAATAACGTCATAAAGCTAGCTTACCGAAGTTAATATTAGC 5 0 5' arm Drosophila_simulans mirbase mir-9 1e-27 dan-mir-9a 5e-39 -29 (((((((((.(((((((...((((((.(((((((........)).))))).))))))...))))))).))))).)))) (-29.00)