mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTTGACATCGGGTCAGAT CTGCAACGCTGTGTGTAGCTGGTTGACATCGGGTCAGATCTGTTTTTTAAGCATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCCAGTGGTTGCTG 5 1 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-133 2e-42 dse-mir-133 1e-46 -40.2 ..(((((((((..(((((((((((((....((..(((((((........)).)))))..))...)))))))))))))..)))).))))).. (-40.20)