mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATGCATTATTTGGTACGACA CGTGTCAGGAGTGCATTTGCA TTGAAGGTTTTGGGCTGCGTGTCAGGAGTGCATTTGCACTGAAACTATCCAAAGCATGTAAATGCATTATTTGGTACGACATTCCAGAACGTACAATC 2 2 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-277 2e-27 der-mir-277 3e-41 -34.52 (((.(.(((((((..(((((..((((((((((((((((.((.............)))))))))))))).))))..))).))..))))))).).))).. (-34.52)