mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGTCAGCAACTTGATTCCAGCAATTG GTTCCTGGAATTAAGTTGACTGTGTAGCC GTTGCAGTTCCTGGAATTAAGTTGACTGTGTAGCCTGTGAGGGCAAGGCTTGAATACTGCTCCTGAAGTCAGCAACTTGATTCCAGCAATTGCGGCCC 7 1 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-284 1e-49 dse-mir-284 8e-51 -41.7 (((((((((.((((((((((((((.(((....((((....))))..(((.........)))........))))))))))))))))).))))))))).. (-41.70)